Missing coverage evidence...
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ACGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCGTG  >  minE/1069165‑1069224 |                                                            aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:311125/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:963898/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:931518/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:875265/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:863982/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:82396/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:739902/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:585494/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:566988/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:477387/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:436902/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:363349/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:1231856/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:300476/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:2131699/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:1868167/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:1582466/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:1481970/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:1397644/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:1384424/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:1337039/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:133677/60‑1 (MQ=255) aCGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCgtg  <  1:1326635/60‑1 (MQ=255) |                                                            ACGAATTACTTAGCCGTGCCGGTATAGCCATTAACGGTTCTGCCCCGGCGGATATTCGTG  >  minE/1069165‑1069224

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑