Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1077454	1077455	2	14 [0]	[0] 59	ydhU	predicted cytochrome

AACAACGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACT  >  minE/1077456‑1077522 |                                                                   aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATa                                  >  1:1988125/1‑35 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATa                                  >  1:552057/1‑35 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATa                                  >  1:322480/1‑35 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATa                                  >  1:481642/1‑35 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATa                                  >  1:1828240/1‑35 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATa                                  >  1:1424720/1‑35 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGAc                            >  1:1628817/1‑41 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTa                    >  1:1552370/1‑49 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGagt  >  1:1138952/1‑65 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGAc   >  1:343992/1‑66 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:378234/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:519186/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:471568/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:454519/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:2090522/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:370561/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:298633/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:255120/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1965620/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:521760/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:54234/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:656598/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:697418/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:770451/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:825737/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:884034/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:892090/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:895633/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:905580/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:914001/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:925725/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:92612/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:938910/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1565445/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1049730/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1086160/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1090176/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1126665/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1136954/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1171311/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1206806/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1369408/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1376756/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1422814/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1479736/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1531251/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:2011986/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1581073/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1609237/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1667577/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1679886/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1687159/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1694657/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1831726/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1837735/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1841096/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1953106/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACt  >  1:1007674/1‑67 (MQ=255) aacaacGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGCGATTAAATTTAGACt  >  1:2007103/1‑67 (MQ=255) |                                                                   AACAACGGCAGCAATCCATACATGACACCAACATAGGCGACCTGCTGTAAGGGATTAAATTTAGACT  >  minE/1077456‑1077522

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑