Missing coverage evidence...
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TTCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTG  >  minE/1085267‑1085318 |                                                    ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1699040/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:977259/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:918480/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:888111/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:825293/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:741006/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:637992/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:525512/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:390219/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:240753/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:2135537/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:205912/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1979698/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:191514/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1894170/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1712205/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:103389/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1676055/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1657528/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1611406/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1610388/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1586812/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1450663/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1390519/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1353937/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1298351/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:127605/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1272648/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1182291/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:1168799/1‑52 (MQ=255) ttCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTg  >  1:114296/1‑52 (MQ=255) |                                                    TTCCGACGTTCAGGCTGCTAAAGATGACGCAGCTCGTGCTAACCAGCGTCTG  >  minE/1085267‑1085318

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑