Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1113374	1113378	5	9 [0]	[0] 79	pps	phosphoenolpyruvate synthase

GCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGCACA  >  minE/1113379‑1113444 |                                                                  gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAgc                           >  1:1189147/1‑40 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGt                        >  1:124307/1‑44 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTaa                      >  1:1814020/1‑46 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCa             >  1:647996/1‑55 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcgca  >  1:1714414/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:219987/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:479158/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:471766/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:459612/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:400476/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:361768/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:356743/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:326172/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:237286/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:599589/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:2148979/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:2075101/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:2066926/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:205088/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:2039971/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:2039516/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:202248/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:695422/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:961876/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:950011/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:939260/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:917117/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:823140/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:799014/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:789927/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:74878/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:73041/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:552761/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:684437/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:681643/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:677998/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:662716/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:653696/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:611436/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1872438/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:568463/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1352784/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:150324/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1485705/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1471121/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1469577/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1456710/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1445709/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1395838/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1391613/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1373206/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1552957/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1331756/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1328179/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1322112/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1281151/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1262734/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1243843/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:123115/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1173351/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1735740/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1109240/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1816540/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1791691/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:178045/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1780182/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1767997/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1765281/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1760598/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1748129/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1971051/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1727123/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1715074/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1690099/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:167798/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1650676/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcaca  >  1:1614468/1‑66 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGcac   >  1:416094/1‑65 (MQ=255) gCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGca    >  1:390093/1‑64 (MQ=255) |                                                                  GCTGGAGCTTTTCACGCTAAATTCCAGCAACTCCGCATAGACGTAACCGGTATCACCTTCGGCACA  >  minE/1113379‑1113444

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑