Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1122969	1123027	59	2 [0]	[0] 16	ihfA	integration host factor (IHF), DNA‑binding protein, alpha subunit

GGGAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAT  >  minE/1123028‑1123071 |                                            gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:1005515/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:1101131/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:160034/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:1601959/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:1793157/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:1861482/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:1917742/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:2064871/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:319715/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:390037/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:41220/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:444867/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:605281/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:644117/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:802782/1‑44 (MQ=255) gggAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAt  >  1:886168/1‑44 (MQ=255) |                                            GGGAATATCCTCGCCCGTTTTCGGGTTACGTCCCGGGCGTTGAT  >  minE/1123028‑1123071

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑