Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1144047	1144049	3	5 [0]	[0] 31	katE/chbG	hydroperoxidase HPII(III)/conserved hypothetical protein

CACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGA  >  minE/1144050‑1144116 |                                                                   cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1885684/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:949688/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:865006/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:765379/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:669570/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:623814/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:616933/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:463946/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:420953/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:393032/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:392224/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:35838/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:299005/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:281324/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1987001/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1964112/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:104584/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:188344/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1854306/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1831261/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1808806/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1779765/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1777086/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1762075/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1748471/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1544795/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:146106/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1355750/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1349262/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1327680/67‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGa  <  1:1167067/67‑1 (MQ=255) |                                                                   CACGCCGCATCTGGCAAACATCCTCACTTACACATCCCGATAACTCCCCAACCGATAACCACGCTGA  >  minE/1144050‑1144116

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑