Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1226924 1226963 40 2 [0] [1] 20 pphA/yebY serine/threonine‑specific protein phosphatase 1/hypothetical protein

AGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAT  >  minE/1226960‑1226999
    |                                   
agTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGa     >  1:650478/1‑37 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:2046270/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:689833/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:561026/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:426093/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:326721/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:322351/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:2154516/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:214879/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:2144809/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:1002750/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:1869144/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:1824932/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:1794582/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:149442/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:1488729/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:1386255/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:1368748/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:1357040/36‑1 (MQ=255)
    tgtgtTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAt  <  1:1219396/36‑1 (MQ=255)
    |                                   
AGTGTGTGTTATGGTTGACTATAAAGTCAGCGAAGGAAAT  >  minE/1226960‑1226999

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: