Missing coverage evidence...
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GGCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACT  >  minE/1238524‑1238590 |                                                                   ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:2118014/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:814916/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:767875/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:716260/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:705276/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:682787/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:533402/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:452016/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:439788/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:333905/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1107853/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1968736/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1893305/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1739295/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1732785/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1729145/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1700285/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1478596/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1307648/67‑1 (MQ=255) ggCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACt  <  1:1277050/67‑1 (MQ=255) |                                                                   GGCTCCTGAAATTGAGTTGTCAGAGCAGGATGATTCACAACGCGTTTCATTCAGAGGATTTATGACT  >  minE/1238524‑1238590

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑