Missing coverage evidence...
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TCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCC  >  minE/1370757‑1370822 |                                                                  tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATga                        >  1:1146509/1‑44 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATga                        >  1:257838/1‑44 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATga                        >  1:254166/1‑44 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATga                        >  1:1665926/1‑44 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATga                        >  1:193074/1‑44 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:762526/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1047716/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:739262/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:723588/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:525035/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:317231/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:237589/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1938057/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:180754/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1724574/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1633152/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1590433/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1467694/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1453572/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1408229/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1243710/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1217508/66‑1 (MQ=255) tCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc  <  1:1179295/66‑1 (MQ=255) |                                                                  TCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCC  >  minE/1370757‑1370822

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑