Missing coverage evidence...
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GTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTG  >  minE/1375554‑1375620 |                                                                   gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATcc                                 >  1:1072873/1‑36 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATGCAAATCAGTATGTTg  >  1:1334487/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGtt   >  1:1263997/1‑66 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGtt   >  1:1535173/1‑66 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGtt   >  1:654905/1‑66 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGtt   >  1:1579699/1‑66 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGtt   >  1:542520/1‑66 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGtt   >  1:362169/1‑66 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:1843964/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:860140/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:768447/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:725335/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:52450/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:293642/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:207948/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:1797876/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:1567609/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:1397020/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:1393523/1‑67 (MQ=255) gTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTg  >  1:120558/1‑67 (MQ=255) |                                                                   GTTCCTGTCGCCGGATGCGGCTTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCATACAAATCAGTATGTTG  >  minE/1375554‑1375620

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑