Missing coverage evidence...
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CGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAT  >  minE/1378708‑1378773 |                                                                  cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:1125001/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:1650399/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:1856014/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:2030823/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:2047981/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:2152374/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:269285/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:29066/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:675297/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:866116/66‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAt  <  1:904300/66‑1 (MQ=255) |                                                                  CGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTAT  >  minE/1378708‑1378773

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑