Missing coverage evidence...
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CACAGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGTCGTCG  >  minE/1386444‑1386510 |                                                                   cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1744508/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:895490/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:852196/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:812771/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:679322/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:560956/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:536522/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:514046/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:51105/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:2011517/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1015577/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1603097/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1492314/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1419873/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1286687/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1268663/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1235596/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1152242/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1031672/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:1020003/67‑1 (MQ=255) cacaGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGGCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGtcgtcg  <  1:694082/67‑1 (MQ=255) |                                                                   CACAGGTATACCGTCTGGTTGCCAAACATGGAGGTCAGGAAGCACAGACCGGCAATCACCGTCGTCG  >  minE/1386444‑1386510

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑