Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1390001	1390037	37	36 [0]	[0] 40	nfo	endonuclease IV with intrinsic 3'‑5' exonuclease activity

AAAAATATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATCC  >  minE/1390038‑1390104 |                                                                   aaaaaTGTCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1241693/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTccc                                  >  1:293195/1‑35 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATcc  >  1:813654/1‑67 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:2001452/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1962207/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:2016001/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:219674/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:312152/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:525040/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:580328/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:631352/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:684665/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:808295/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:829601/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:838147/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:867421/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:86994/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:919359/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:948619/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:975956/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:984762/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1399028/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1105080/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1130451/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1152396/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1190526/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1244182/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1275699/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1337612/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1371461/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1386463/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1037659/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:146723/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1572336/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1609778/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1720481/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1726092/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1815363/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1833143/66‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATc   <  1:1952902/66‑1 (MQ=255) |                                                                   AAAAATATCACTACACATCGGCGCAAATTCTTCCCCACGACAGTTATCTGATTAACCTCGGACATCC  >  minE/1390038‑1390104

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑