Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1441939	1441954	16	30 [0]	[0] 21	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

TTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTAT  >  minE/1441955‑1442020 |                                                                  ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1724492/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:984933/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:845804/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:578753/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:54116/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:44530/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:434943/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:348598/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:2100861/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:2092603/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1914611/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1091838/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1645619/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:151522/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1473290/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1358672/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1329088/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1316431/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1250052/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1156223/66‑1 (MQ=255) ttGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCtat  <  1:1099913/66‑1 (MQ=255) |                                                                  TTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTAT  >  minE/1441955‑1442020

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑