Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1484803	1484807	5	2 [0]	[0] 9	menF	isochorismate synthase 2

TGCTGCCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCA  >  minE/1484808‑1484870 |                                                               tgctgcCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCa  >  1:1343645/1‑63 (MQ=255) tgctgcCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCa  >  1:1401016/1‑63 (MQ=255) tgctgcCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCa  >  1:1702198/1‑63 (MQ=255) tgctgcCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCa  >  1:1763348/1‑63 (MQ=255) tgctgcCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCa  >  1:235164/1‑63 (MQ=255) tgctgcCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCa  >  1:566901/1‑63 (MQ=255) tgctgcCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCa  >  1:679436/1‑63 (MQ=255) tgctgcCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCa  >  1:68848/1‑63 (MQ=255) tgctgcCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATAACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTcc   >  1:1761933/1‑62 (MQ=255) |                                                               TGCTGCCGTTGGCTGCAACTGATGTAAACAGATCACATCATCCGCTTTGTTGAGTGAAGTCCA  >  minE/1484808‑1484870

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑