Missing coverage evidence...
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CATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAGGG  >  minE/1522263‑1522328 |                                                                  cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1201944/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:944221/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:72702/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:698722/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:57925/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:474974/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:254354/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:242616/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:2088019/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:195205/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1828316/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1466102/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1458149/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1415885/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1379578/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1333195/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1320820/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1307543/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1224709/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:1086330/66‑1 (MQ=255) cATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACATGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAggg  <  1:159300/66‑1 (MQ=255) |                                                                  CATGCCCAATAAACTTGCTATAAGCTTCAAACACTTGCGTAGTACCGCGTGCTTTACCTTCCAGGG  >  minE/1522263‑1522328

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑