Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1528808	1528928	121	27 [0]	[0] 51	trmC	fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme

GATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGT  >  minE/1528929‑1528993 |                                                                 gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAAc                              >  1:1736602/1‑37 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGaa                         >  1:1926074/1‑42 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:38466/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1758657/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1794617/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1881682/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1953744/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1978518/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:2016200/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:2116715/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:2157468/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:233814/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:316878/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1064642/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:406221/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:460338/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:563411/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:583850/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:594508/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:704514/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:79008/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:800326/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:821149/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:885953/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:92105/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1704965/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1051558/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1082442/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1164022/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:120811/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1232589/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1240253/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1287423/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1347451/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1358507/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1362947/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1420129/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1462894/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1468261/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1470377/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:149418/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:15221/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1548825/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1633395/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1633818/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1649277/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1658541/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttgt  >  1:1670123/1‑65 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAttg   >  1:1395808/1‑64 (MQ=255) gATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAAt     >  1:339116/1‑62 (MQ=255) gATTACGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCAGaa                         >  1:1727728/1‑42 (MQ=38) |                                                                 GATTCCGATGGATGCCAGTACGCTGGCGGCGTTAAACCCGAATCGGTTATGGGTGCGGAAATTGT  >  minE/1528929‑1528993

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑