Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1562947	1562969	23	3 [0]	[1] 55	evgS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

GCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATA  >  minE/1562955‑1563036                |                                                                   gCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACg                 <  1:2099652/67‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1451088/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:197183/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:194579/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:2039946/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1910477/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1775067/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:17188/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1686481/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1683682/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1586385/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:24318/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1454687/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:398245/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1371457/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1005410/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:75021/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:704394/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1295038/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1323662/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGtt               <  1:1384251/54‑1 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:540742/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:2115394/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:2102804/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:410694/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:589344/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:613641/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:2091980/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:66487/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:960632/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:367177/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:83305/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:899647/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1991597/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1356352/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1016106/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:102996/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1072230/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1096261/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1142204/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1153930/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1219044/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1276005/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1349366/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1399751/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1431198/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1541474/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1606452/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1665797/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1686758/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1693555/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1939529/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:1958831/1‑67 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAat   >  1:1990146/1‑66 (MQ=255)                cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATAATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAata  >  1:80422/1‑67 (MQ=255)                |                                                                   GCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATA  >  minE/1562955‑1563036

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑