Missing coverage evidence...
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AAACTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGC  >  minE/1620876‑1620942 |                                                                   aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGCTGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:126064/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGTCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:770939/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:613763/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:214901/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:2155479/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:235086/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:333481/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:394673/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:491202/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:513399/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:519120/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:593743/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:609240/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:2128488/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:69530/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:697432/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:774412/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:871385/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:885718/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:9091/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:985909/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1824232/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1159206/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1310686/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1530529/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1577962/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1582686/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1677978/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:168346/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1756623/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:2129170/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1870314/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1906715/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1965485/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:2007564/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:2021454/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:2108161/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:2123521/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:2128265/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1026660/67‑1 (MQ=255) aaaCTTGACGCTACTCCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGc  <  1:1336850/67‑1 (MQ=255) |                                                                   AAACTTGACGCTACTGCCATCAATCACTTTGATGCCGCCTTTGCCGGTCACCGATTTGAAGCTCGGC  >  minE/1620876‑1620942

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑