Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1636128	1636196	69	7 [1]	[0] 26	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

ATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTG  >  minE/1636197‑1636263 |                                                                   aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAAt                              >  1:865912/1‑39 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGa                         >  1:922389/1‑44 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTctct   >  1:1171215/1‑66 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTctct   >  1:1820437/1‑66 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:387010/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:893433/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:807968/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:805189/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:793127/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:772863/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:731450/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:669132/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:626180/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:452411/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:391776/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:106412/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:352831/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:267659/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:208459/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:2012118/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:1943677/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:1920014/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:1906414/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:1756807/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:1691115/1‑67 (MQ=255) aTGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTg  >  1:1156157/1‑67 (MQ=255) |                                                                   ATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTG  >  minE/1636197‑1636263

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑