Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1741716	1741723	8	4 [0]	[0] 16	rseA	anti‑sigma factor

CATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGC  >  minE/1741724‑1741758 |                                   cATTATTGTGCTTGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:1579392/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:1019354/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:1283269/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:134092/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:1628779/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:1641766/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:1645775/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:1697536/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:2050359/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:280010/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:464979/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:467780/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:482304/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:52630/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:744689/35‑1 (MQ=255) cATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGc  <  1:87369/35‑1 (MQ=255) |                                   CATTATAGTGCTGGACGCCAACGATAACTGCAAGC  >  minE/1741724‑1741758

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑