Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1771276	1771331	56	16 [0]	[0] 43	pheA	fused chorismate mutase P and prephenate dehydratase

TAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCT  >  minE/1771332‑1771398 |                                                                   tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:562653/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:2090920/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:232593/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:243733/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:268707/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:275566/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:332111/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:335039/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:369623/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:507605/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:530077/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:2054699/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:596270/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:606030/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:631567/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:63472/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:686567/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:70830/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:747792/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:78359/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:856001/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:863108/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1588669/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1151162/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:117210/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1200919/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1234112/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1475451/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1486141/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1497284/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1533094/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1559015/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1577427/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1130868/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1597562/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1735213/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1753319/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1770049/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1774522/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1876540/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1879817/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:1890983/1‑67 (MQ=255) tAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCt  >  1:192218/1‑67 (MQ=255) |                                                                   TAATGGCGACCGGGCAACAAGCCGGTGCGCTGGTTGAAGCGTTGCTGGTACTGCGCAACCACAATCT  >  minE/1771332‑1771398

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑