Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1777842 1777845 4 11 [0] [0] 26 trmD tRNA (guanine‑1‑)‑methyltransferase

CATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCG  >  minE/1777846‑1777911
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cATCCCCGGTCCGCCGCCGTACGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1495227/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCGGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1611341/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1938935/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:901667/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:85894/66‑1 (MQ=255)
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cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:780463/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:739210/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:723789/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:592644/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:591182/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:318452/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:204686/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:2024750/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1963166/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:106314/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1898218/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1889230/66‑1 (MQ=255)
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cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1479858/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1461377/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:141037/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1229399/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:1159026/66‑1 (MQ=255)
cATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTcgcg  <  1:108540/66‑1 (MQ=255)
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CATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCG  >  minE/1777846‑1777911

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: