Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1785296	1785311	16	32 [0]	[0] 46	recN	recombination and repair protein

GCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATTTG  >  minE/1785312‑1785378 |                                                                   gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTg                           >  1:1836026/1‑42 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCg                    >  1:2069965/1‑49 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTAttt   >  1:666901/1‑66 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTAttt   >  1:1247330/1‑66 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTAttt   >  1:423951/1‑66 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTAttt   >  1:2123046/1‑66 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:226205/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:167361/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1688801/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1719158/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1889966/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:2012824/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:2062802/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:2110283/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:22092/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1598753/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:272874/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:401954/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:559905/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:714023/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:791929/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:908226/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:969344/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:987123/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1351222/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1090423/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:110768/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1125461/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1172414/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1219127/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1230596/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1262755/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1264227/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1306772/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1049104/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1373140/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1395410/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1438932/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1439727/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1447003/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1451068/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1540910/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1565560/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1572201/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATttg  >  1:1598705/1‑67 (MQ=255) gCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCACAACCGACTATttg  >  1:1156203/1‑67 (MQ=255) |                                                                   GCTGAAGCCAGCGATGAACTGCGCCACTACTGCGATCGTCTGGATCTCGATCCCAACCGACTATTTG  >  minE/1785312‑1785378

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑