Missing coverage evidence...
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GGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTGG  >  minE/1817772‑1817838 |                                                                   ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGgctg        >  1:883025/1‑61 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGGTGCTGTgg  >  1:888960/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCtgtg   >  1:1303656/1‑66 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCtgtg   >  1:1319122/1‑66 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCtgtg   >  1:1433120/1‑66 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCtgtg   >  1:1007976/1‑66 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:223376/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:980262/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:945681/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:787854/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:78066/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:66344/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:59151/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:54236/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:533327/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:402388/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:339008/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:2001832/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:1818444/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:1741816/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:1521606/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:1406400/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:1323196/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:1321938/1‑67 (MQ=255) ggTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTgg  >  1:1045244/1‑67 (MQ=255) |                                                                   GGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTGTTGATGGTTGCCCAGCGGCTGCTGTGG  >  minE/1817772‑1817838

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑