Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1827642	1827675	34	29 [1]	[0] 42	mutS	methyl‑directed mismatch repair protein

CTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTG  >  minE/1827676‑1827742 |                                                                   cTGATACGCTGGCTGAATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGa                   >  1:5186/1‑50 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGGGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:2148522/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGGGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:2150864/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTAtt   >  1:1489789/1‑66 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTAtt   >  1:2045793/1‑66 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTAtt   >  1:1757590/1‑66 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTAtt   >  1:1656201/1‑66 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTAtt   >  1:482143/1‑66 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTAtt   >  1:820643/1‑66 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:554521/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:575752/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:671561/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:200929/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:339512/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:337746/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:823511/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:28001/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:249076/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:218194/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:920867/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:967732/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:2094503/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:976602/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1423147/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1067749/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1093888/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1145316/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1170200/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1186826/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1303690/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1395702/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:2050525/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:156793/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:174754/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1810525/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1870173/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1892896/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1944794/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1950446/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1062654/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTCTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1222373/1‑67 (MQ=255) cTGAAACGCTGGCTGCAAATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTg  >  1:1115994/1‑67 (MQ=255) |                                                                   CTGAAACGCTGGCTGCATATGCCAGTGCGCGATACCCGCGTGTTGCTTGAGCGCCAGCAAACTATTG  >  minE/1827676‑1827742

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑