Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1848481	1848528	48	3 [0]	[0] 30	ygbT	conserved hypothetical protein

CTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCT  >  minE/1848529‑1848595 |                                                                   cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCTGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:692483/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:38735/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:959390/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:948526/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:878156/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:857013/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:850688/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:829898/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:761162/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:708688/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:649927/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:524746/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:521065/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:407516/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:407129/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1103951/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:372129/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:279016/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:2158193/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1972819/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1896942/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1788986/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1746326/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1730004/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1669200/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1487669/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:146221/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1404623/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1301970/67‑1 (MQ=255) cTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCt  <  1:1152030/67‑1 (MQ=255) |                                                                   CTCACCAGGGTTACGACGCGCTATCTCAAAAGCTTTCGGTACAACAGTGTCAAATTTAATGATGTCT  >  minE/1848529‑1848595

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑