Missing coverage evidence...
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TGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCA  >  minE/1867091‑1867131 |                                         tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:204904/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:977503/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:847798/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:764335/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:753175/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:601000/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:589276/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:577861/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:311880/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:235204/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:2105341/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:2099742/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:2051151/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:105080/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:20409/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:1901105/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:1849340/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:1762461/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:170087/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:1590015/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:1529050/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:1390070/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:1200445/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:1190824/41‑1 (MQ=255) tGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCa  <  1:10799/41‑1 (MQ=255) |                                         TGAAGATTTTTTGCCGACCAATATGGTCGGAGATCCACCCA  >  minE/1867091‑1867131

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑