Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1886116	1886135	20	12 [0]	[0] 37	barA	hybrid sensory histidine kinase, in two‑component regulatory system with UvrY

GCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGATAT  >  minE/1886136‑1886202 |                                                                   gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGCACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:77756/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGATCCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCAAGCTGGata   >  1:849187/1‑66 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGcagcag                     >  1:2095001/1‑48 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:426629/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1012920/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:2063537/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:278807/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:304016/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:370176/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:388531/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:410553/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1999401/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:446688/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:528859/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:623132/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:648821/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:843479/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:930590/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1822131/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1092467/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1106185/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:112931/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1234748/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1244576/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1255450/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1522946/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1561940/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1611734/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGatat  >  1:1993277/1‑67 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGata   >  1:133386/1‑66 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGata   >  1:1285073/1‑66 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGata   >  1:1531848/1‑66 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGata   >  1:1237535/1‑66 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGata   >  1:301882/1‑66 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGata   >  1:633968/1‑66 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGata   >  1:1215749/1‑66 (MQ=255) gCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGata   >  1:1064864/1‑66 (MQ=255) |                                                                   GCCTCGCAGGTAAGCGCCTGGCCTATGTCGAACCAAACTCCGCAGCAGCGCAATGCACGCTGGATAT  >  minE/1886136‑1886202

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑