Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1976882	1976892	11	3 [0]	[0] 30	sprT	conserved hypothetical protein

ACGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCT  >  minE/1976893‑1976958 |                                                                  aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:2126036/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:979114/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:963258/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:886224/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:859802/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:845060/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:822243/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:821370/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:606216/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:518654/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:469516/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:442876/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:263772/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:259133/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1082711/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:211351/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:2073199/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:186832/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:182012/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1776761/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1723261/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:169478/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1693551/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1490921/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1450947/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1421094/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1347648/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1318578/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCt  <  1:1239226/66‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTCGAAAACAGTGAAGCt  <  1:844125/66‑1 (MQ=255) |                                                                  ACGGCCTGGCTGGAAAGCTATGAAATTCGCCTCAATCCCGTTTTGCTGTTGGAAAACAGTGAAGCT  >  minE/1976893‑1976958

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑