Missing coverage evidence...
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GATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCA  >  minE/2164061‑2164127 |                                                                   gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCGGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1039044/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGc   >  1:1769096/1‑66 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGc   >  1:1410474/1‑66 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:830144/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:774487/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:748786/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:842948/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:535099/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:471156/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:462190/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:460928/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:318343/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:253308/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:2131590/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1926506/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1884414/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1858473/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:918930/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:18197/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1617447/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1606022/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1584860/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1577634/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1550061/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1509309/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1485/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1464928/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1463859/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:132198/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1310272/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1295116/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1266016/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCa  >  1:1204478/1‑67 (MQ=255) gATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTATCCGCACTATAAGTgg                       >  1:1692022/1‑46 (MQ=255) |                                                                   GATAACGCCACCAGCATACCCAGACTGGTTTCCGCACTATAAGTGGTCAGAACCAGATAACCTTGCA  >  minE/2164061‑2164127

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑