Missing coverage evidence...
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TCTTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGTTTT  >  minE/2245488‑2245553 |                                                                  tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATgg                             >  1:204303/1‑39 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:2110468/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:989894/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:918797/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:811065/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:754129/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:705118/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:669023/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:64000/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:630192/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:540882/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:51363/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:358956/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:306799/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:299401/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1158838/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1998616/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1983802/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1898245/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1888520/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1825930/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1716748/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1655847/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1378191/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1346368/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1250850/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGtttt  >  1:1228206/1‑66 (MQ=255) tctTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGttt   >  1:1734542/1‑65 (MQ=255) |                                                                  TCTTGCACTACCTTTGCATCACTGGCATGTTTAACATGGTTTTTACATTTCTCACTGAGCAGTTTT  >  minE/2245488‑2245553

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑