Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2288804	2288865–2288821	18–62	11 [0]	[0] 42	argE/ppc	acetylornithine deacetylase/phosphoenolpyruvate carboxylase

CCAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAT  >  minE/2288866‑2288932 |                                                                   ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCa        >  1:952637/1‑61 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGa   >  1:2135177/1‑66 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGa   >  1:422837/1‑66 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:367599/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1131403/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:2149711/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:243197/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:270344/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:304233/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:33223/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:339618/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:357000/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:819945/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:864910/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:535218/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:599183/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:717800/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:724846/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:7585/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:785168/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1659897/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1014487/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1167925/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1204850/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1255847/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1274472/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1328315/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1442634/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1511449/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1589559/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:2004448/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1680311/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1816583/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1836734/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1841567/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1861398/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:190362/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1961330/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:1966642/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:199793/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCAGACCGACAGTGACTCAAACGAt  >  1:568971/1‑67 (MQ=255) ccAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATACGACCGACAGTGAc           >  1:2132797/1‑58 (MQ=255) |                                                                   CCAGTGCCGCAATAATGTCGGATGCGATACTTGCGCATCTTATCCGACCGACAGTGACTCAAACGAT  >  minE/2288866‑2288932

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑