Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2342420	2342425	6	5 [0]	[0] 30	glnL	sensory kinase in two‑component regulatory system with GlnG

GTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGATGCAAGAAAGTCTGGAGGCGGG  >  minE/2342426‑2342491 |                                                                  gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATc                               >  1:594298/1‑37 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAg                            >  1:153793/1‑40 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:1340866/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:964631/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:894452/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:825096/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:76749/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:684891/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:652348/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:335867/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:307525/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:302373/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:249125/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:23179/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:2107468/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:2074141/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:1972655/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:1881424/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:1792122/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:1675383/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:1641214/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:1570290/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:1037339/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGATGCAAGAAAGTCTGGAGGCggg  >  1:202254/1‑66 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGATGCAAGAAAGTCTGGAGGCggg  >  1:1928064/1‑66 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGATGCAAGAAAGTCTGGAGGCggg  >  1:470338/1‑66 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGATGCAAGAAAGTCTGGAGGCggg  >  1:555208/1‑66 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGATGCAAGAAAGTCTGGAGGCggg  >  1:1693377/1‑66 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATAACGAGCt                          >  1:238366/1‑42 (MQ=255) gTTACCGGAACTGTTGAGCTAATTCTCATTAAATATCGAGCt                          >  1:89339/1‑42 (MQ=255) |                                                                  GTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGATGCAAGAAAGTCTGGAGGCGGG  >  minE/2342426‑2342491

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑