Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2344101	2344113	13	31 [0]	[0] 41	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

GTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAG  >  minE/2344114‑2344180 |                                                                   gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCa   >  1:1361414/1‑66 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCa   >  1:1726146/1‑66 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCa   >  1:1433436/1‑66 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:57676/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1999048/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:2042189/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:204459/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:2079389/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:2149102/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:2153061/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:393236/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:396306/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:506877/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1862118/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:625014/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:668696/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:716081/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:72446/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:786995/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:936561/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:940531/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:999358/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1582595/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1021312/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1080097/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1151041/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:115851/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:122613/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1252838/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1387732/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1412596/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1529441/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1896456/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1627773/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1759277/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1790417/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1792770/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1817832/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1834038/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:1009373/1‑67 (MQ=255) gTTTTACCGCGTTGGCCGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAg  >  1:284311/1‑67 (MQ=255) |                                                                   GTTTTACCGCGTTGGCGGCTATGCGCCGGTGAAAGTGGATGTGCGGATTATCGCTGCCACTCACCAG  >  minE/2344114‑2344180

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑