Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2374157 2374164 8 13 [0] [0] 44 rfaH DNA‑binding transcriptional antiterminator

GCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAA  >  minE/2374165‑2374231
|                                                                  
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATTGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTTTtaa  <  1:4705/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1835447/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1726631/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1913129/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1971070/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1976450/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:2054264/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:2124265/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:21245/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:329496/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:411723/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:417199/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:503718/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:521350/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:539651/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:643469/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:644202/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:697699/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:780473/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:845039/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:938142/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:972882/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1328354/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1041578/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1110021/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:111277/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1118822/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1192443/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1239153/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1241756/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1243950/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:12771/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1307410/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1036140/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1404709/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1435458/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1480116/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1483503/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1492330/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1493678/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1544724/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1555064/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1563947/67‑1 (MQ=255)
gCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATtaa  <  1:1626386/67‑1 (MQ=255)
|                                                                  
GCTTTCAGGCCATTTTCACCGAACCCGATGGTGAGGCTCGCTCCATGCTATTGCTTAATCTTATTAA  >  minE/2374165‑2374231

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: