Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2389947	2389951	5	15 [0]	[0] 15	rhtB	neutral amino‑acid efflux system

TCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTATT  >  minE/2389952‑2390018 |                                                                   tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTTATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:426390/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:1155885/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:1625213/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:1811851/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:1876181/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:1967414/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:2111578/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:227560/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:230510/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:310063/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:339644/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:675562/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:841467/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:85430/1‑67 (MQ=255) tCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTAtt  >  1:923781/1‑67 (MQ=255) |                                                                   TCCGCAATTCATCATGCCGCAACAGCCGCAACTGATGCAGTATATCGTGCTCGGCGTCACCACTATT  >  minE/2389952‑2390018

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑