Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2394951	2394973	23	13 [0]	[0] 43	rarD	predicted chloramphenical resistance permease

AATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAACC  >  minE/2394974‑2395040 |                                                                   aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACa          >  1:1494720/1‑59 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGc        >  1:257810/1‑61 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAccc  >  1:797514/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAccc  >  1:1585089/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:524894/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:2069360/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:2104794/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:24248/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:290468/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:406801/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:433542/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:488580/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:200914/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:563531/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:597225/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:610681/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:618306/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:618385/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:710355/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:779607/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:825951/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:988648/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1326088/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1078568/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1144845/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1150108/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1169199/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1213199/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1254287/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1258730/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1294852/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:2009627/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1348067/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1538356/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1602722/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1686250/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:173823/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1893054/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:2001164/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1016586/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAAc   >  1:272440/1‑66 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTCGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1154298/1‑67 (MQ=255) aaTCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTCGCTATTGCCGACAGCTCAAcc  >  1:1151834/1‑67 (MQ=255) |                                                                   AATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATTGCCGACAGCTCAACC  >  minE/2394974‑2395040

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑