Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2444712	2444846	135	35 [0]	[0] 45	ilvD	dihydroxyacid dehydratase

GAGATGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGGTGT  >  minE/2444847‑2444912 |                                                                  gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:459872/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1034375/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:2046193/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:2082078/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:2111796/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:2135284/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:301601/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:318136/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:345260/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:348756/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:349554/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1998225/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:463589/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:471047/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:480928/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:556106/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:616156/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:624402/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:646074/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:7385/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:784005/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:995191/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1499382/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1047613/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1083801/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1127882/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1167445/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1297326/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1315932/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1453342/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1472956/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1493894/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:149627/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1984066/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1519694/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:15344/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1621002/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1683458/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1695341/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1737708/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1815072/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1845843/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:1919631/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATCgtgt  <  1:213453/66‑1 (MQ=255) gagaTGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATAGCAATCCCATCATCCACCGCAATGgtgt  <  1:957814/66‑1 (MQ=255) |                                                                  GAGATGGCAGTGAATAAAGCATCCCCCCGTGGCCCATGGCAATCCCATCATCCACCGCAATGGTGT  >  minE/2444847‑2444912

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑