Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2518470	2518481	12	10 [0]	[0] 29	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

ATTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATGTGG  >  minE/2518482‑2518547 |                                                                  aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1821507/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:971279/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:889574/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:884711/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:755000/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:552228/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:443121/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:377330/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:334512/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:319311/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:2100042/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1929899/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1877541/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1873278/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1046387/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1813736/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1809565/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1801403/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1761010/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1706374/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1580105/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1560096/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1558920/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1321741/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1099121/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1073133/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1071978/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:1056428/66‑1 (MQ=255) aTTACGCGATAACGGGTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATgtgg  <  1:541490/66‑1 (MQ=255) |                                                                  ATTACGCGATAACGGTTGGGATACAGCGCCTCAAAACCCAGCTCTTCGAGTTCGGTTTTAATGTGG  >  minE/2518482‑2518547

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑