Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2518614	2518616	3	42 [0]	[0] 44	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

TCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACG  >  minE/2518617‑2518682 |                                                                  tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTCCGGTCGGCAAGTTTCATGAGGATGAcg  <  1:1953922/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:513543/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:2124788/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:239861/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:269752/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:277462/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:312076/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:316981/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:347561/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:37607/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:441532/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:477148/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:2075771/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:533143/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:55904/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:661345/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:693311/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:697951/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:711603/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:779524/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:886302/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:939127/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:951175/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1561998/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:107030/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1156619/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1185475/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1205362/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1212159/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1322618/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1435304/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1455190/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1479285/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1484882/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1065815/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1582022/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:16328/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1636582/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1707393/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1811799/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1814682/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:1945271/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:195311/66‑1 (MQ=255) tCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGAcg  <  1:2045449/66‑1 (MQ=255) |                                                                  TCCGGGCGAAGTGAGCCCAGCGTGCGCATGTTGTGGGTACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACG  >  minE/2518617‑2518682

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑