Missing coverage evidence...
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GCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTC  >  minE/2638438‑2638503 |                                                                  gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGGTCTCTAACCTc  <  1:439866/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:2106394/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:201546/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:2146025/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:240187/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:251527/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:266505/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:283894/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:293760/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:345923/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:401124/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:497716/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:756296/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:768930/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:811042/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:83512/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:850443/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:888379/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:984769/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1647993/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1082756/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:109807/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1105887/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:113206/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1231020/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1373876/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1438656/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1509158/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1562241/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1046034/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1657407/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:165913/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1763639/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1806885/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1834047/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:190031/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1969454/66‑1 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc  <  1:1976161/66‑1 (MQ=255) |                                                                  GCGATGGGCCGCGCGATTGTGCGCGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTC  >  minE/2638438‑2638503

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑