Missing coverage evidence...
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ATTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCT  >  minE/2659041‑2659090 |                                                  aTTGGTGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:274631/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGccc   >  1:1650688/1‑49 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGccc   >  1:2004251/1‑49 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGccc   >  1:437491/1‑49 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGccc   >  1:1064331/1‑49 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:48754/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:477993/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:639085/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:431996/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1948600/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:395448/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:347901/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:2114881/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:206256/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:2024977/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:2019884/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:70797/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1991657/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1025951/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1869794/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1822788/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1792784/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1705119/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1698071/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1663933/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1445245/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1281727/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1159417/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1061836/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCCGCCCCATATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1085115/1‑50 (MQ=255) aTTGATGCAGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCt  >  1:1144599/1‑50 (MQ=255) |                                                  ATTGATGCCGCCCCCTATCACAATCAGATCTTTGGTTTCCATGCTGCCCT  >  minE/2659041‑2659090

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑