Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2661836	2661858	23	20 [0]	[0] 43	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

AATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTCAGC  >  minE/2661859‑2661923 |                                                                 aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAATGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1172895/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:699217/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:284250/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:329991/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:368694/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:381014/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:438642/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:446739/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:479455/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:584779/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:611887/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:655659/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:218172/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:715254/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:789538/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:885983/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:888537/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:907138/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:949873/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:984871/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:990422/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:993921/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1595665/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1057866/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1204877/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1266343/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1300409/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1350830/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1466841/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1492110/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1498580/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1520966/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1527888/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:254652/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1631055/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1640195/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1776379/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1779197/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1829925/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:2001986/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:213371/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:2139246/65‑1 (MQ=255) aaTCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTcagc  <  1:1030824/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AATCACTGCTCACCTGGCGATCGCTGCCAAACGGGTAAAAGGTTTTCTCTTCAATGGCTTTCAGC  >  minE/2661859‑2661923

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑