Missing coverage evidence...
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ACGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTGA  >  minE/238772‑238838 |                                                                   aCGGGGCAGCTCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1828814/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCTTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:189391/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGTTga  <  1:467405/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:985079/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1061884/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:893996/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:882276/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:876868/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:786480/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:511984/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:508760/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:330139/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:2156836/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:2085913/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1895284/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1865857/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1831904/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1781899/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1474015/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1447870/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1356967/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1270320/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1213731/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:1208188/67‑1 (MQ=255) aCGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTga  <  1:112474/67‑1 (MQ=255) |                                                                   ACGGGGCAGCGCGGAACGGTAGGTATGGGCATTCCTGGCTCAATTTCGCCTTACACCGGTGTGGTGA  >  minE/238772‑238838

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑