Missing coverage evidence...
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AGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGT  >  minE/2825971‑2826006 |                                    aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTg   >  1:473773/1‑35 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTg   >  1:2033863/1‑35 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTg   >  1:2116554/1‑35 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:2076958/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:987773/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:966844/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:964273/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:861262/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:852003/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:82020/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:580583/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:547652/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:480671/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:352291/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:1984448/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:1802637/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:1628636/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:1625500/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:1573172/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:155702/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:1422555/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:1380915/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:1249780/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:112058/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTCGAACTGt  >  1:1903283/1‑36 (MQ=255) aGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCATGGAACTGt  >  1:1001394/1‑36 (MQ=255) aGCAAGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGt  >  1:277850/1‑36 (MQ=255) |                                    AGCACGTATGGGTGCTGTAGCGCCGCCTGGAACTGT  >  minE/2825971‑2826006

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑