Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA minE 879,563 T→C 100% Y18H (TAT→CAT)  yciM → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE879,5630TC100.0% 60.7 / NA 17Y18H (TAT→CAT) yciMconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/17);  total (0/17)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

TAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGTATATGG  >  minE/879503‑879569
                                                            |      
tatcTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTTGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:1651146/64‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:1821514/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:990710/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:85432/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:779826/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:365560/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:1868076/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:105631/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:1637412/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:1541687/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:1501607/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:1413556/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:1216704/67‑1 (MQ=255)
tAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:1127034/67‑1 (MQ=255)
 aaCTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:2032896/66‑1 (MQ=255)
 aaCTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:466032/66‑1 (MQ=255)
                              cTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGCATATgg  <  1:35072/37‑1 (MQ=255)
                                                            |      
TAACTTTCTATGCTGGAGTTGTTGTTTCTGCTTTTGCCTGTAGCCGCTGCCTATGGCTGGTATATGG  >  minE/879503‑879569

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: