Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	minE	909,573	C→T	100%	L584L (CTG→TTG)	ycjT →	predicted hydrolase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	909,573	0	C	T	100.0%	57.8 / NA	19	L584L (CTG→TTG)	ycjT	predicted hydrolase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (1/18);  total (1/18)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

GATGCAGATCCTCAAACAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGCTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGCC  >  minE/909527‑909608                                               |                                    gaTGCAGATCCTCAAACAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCg                 <  1:770962/67‑1 (MQ=255) gaTGCAGATCCTCAAACAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCg                 <  1:1501581/67‑1 (MQ=255) gaTGCAGATCCTCAAACAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCg                 <  1:628221/67‑1 (MQ=255) gaTGCAGATCCTCAAACAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCg                 <  1:625529/67‑1 (MQ=255) gaTGCAGATCCTCAAACAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCg                 <  1:1604111/67‑1 (MQ=255) gaTGCAGATCCTCAAACAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCg                 <  1:539016/67‑1 (MQ=255)       gATCCTCAAACAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCg           >  1:1418154/1‑67 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:1625525/67‑1 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:85178/67‑1 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:79975/67‑1 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:344412/67‑1 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:1576859/67‑1 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:1547180/67‑1 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:1364902/67‑1 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:1350536/67‑1 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:1256693/67‑1 (MQ=255)                aCAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGGTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:1075328/67‑1 (MQ=255)                               gATGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:46535/52‑1 (MQ=255)                                aTGCTCAATTACATGTTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGcc  <  1:83117/51‑1 (MQ=255)                                               |                                    GATGCAGATCCTCAAACAAGCTGATGTGGTGATGCTCAATTACATGCTGCCGGAGCAGTTCTCAGCGGCATCGTGTCTTGCC  >  minE/909527‑909608

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑