| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 225915 | NA (NA) | 5 (0.120) | 4/84 | NT | NA | noncoding (157/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | W3110S.gb | = 225926 | NA (NA) | noncoding (168/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/225838‑225915‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA < W3110S.gb/225926‑225857 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:954636/1‑71GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:863053/71‑1GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:2665205/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:4294376/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:4166344/70‑1 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACTCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:779004/71‑1 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:2170508/1‑71 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3045103/1‑71 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:1173501/1‑70 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:4192481/1‑70 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:3385489/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2053604/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1131474/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3120396/1‑70 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:1032071/1‑70 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:2760308/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:2048543/71‑1 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:1065914/67‑1 GATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC < 1:2943234/70‑1 ATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2285152/66‑1 ATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:2008833/64‑1 TATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:976498/65‑1 TGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:251115/59‑1 GAACCGTTATAACCGTCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:2579441/1‑64 AACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:1479599/1‑60 CCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC > 1:3977880/1‑56 CCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:1571422/56‑1 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:459495/1‑60 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:1312246/1‑56 TAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:1001659/51‑1 AACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:3987408/52‑1 GCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:2346616/1‑49 TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:2602763/1‑43 TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:1328950/41‑1 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:4131953/43‑1 TCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:3796473/1‑43 TCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1432109/41‑1 TCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3594509/1‑40 TCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:937403/1‑40 TCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:627514/1‑40 CGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA > 1:1331865/1‑61 CGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:3797007/1‑35 AATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:3101577/1‑35 CCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:1896319/43‑1 TTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTT < 1:3172535/35‑1 TCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA > 1:3589195/1‑38 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:3718031/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:3657036/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:653401/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:1259343/63‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATT > 1:384092/1‑59 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTT < 1:2745364/51‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:3657334/1‑40 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTcg > 1:286308/1‑45 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:3260152/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:4445163/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:3276892/1‑70 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCC > 1:2614540/1‑53 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT > 1:693101/1‑45 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT < 1:2405004/71‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1593906/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:3623411/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:2880156/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:3350938/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGC > 1:1757339/1‑67 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCAT > 1:1974142/1‑56 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCC < 1:871624/53‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:3139663/44‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:3851465/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2220396/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:3043641/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:4359662/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:69814/1‑38 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTT < 1:3491424/71‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:4091299/1‑70 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTCTCCCCATTCGGAAATCGC < 1:666689/66‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACGGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:408115/60‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC < 1:4473157/42‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:3499554/39‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCC > 1:1435862/1‑50 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:1667002/42‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:2256117/42‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:4549832/38‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGGCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAA < 1:4390956/61‑1 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1811179/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:2002971/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1455259/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:552276/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCC > 1:1030951/1‑49 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTAGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1455350/1‑70 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:2805688/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:2257686/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT > 1:110743/1‑70 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT > 1:1008811/1‑70 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA < 1:1169055/69‑1 CCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCagt < 1:1233273/65‑4 CCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAA > 1:3059424/1‑71 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |