New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | W3110S.gb | 381043 = | NA (NA) | 3 (0.070) | 3/86 | NT | NA | coding (146/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' |
? | W3110S.gb | 381065 = | NA (NA) | coding (168/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/381119‑381043 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccgtatACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCA > W3110S.gb/381065‑381134 CAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACAT < 1:3669885/71‑1 AGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC < 1:1061182/71‑1 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC > 1:701704/1‑71 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC > 1:3699479/1‑71 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC > 1:356593/1‑71 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTATCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC > 1:4362044/1‑71 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:1154729/71‑1 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:2810759/71‑1 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG > 1:1980801/1‑70 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG > 1:618146/1‑70 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG > 1:2764147/1‑70 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG > 1:348544/1‑70 CCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTA < 1:2044527/71‑1 CCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTA < 1:2260332/71‑1 CCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:4000061/70‑1 CCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:2900288/70‑1 CCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT < 1:4306744/71‑1 CCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTA < 1:3341807/70‑1 CCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:1174225/69‑1 CATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT > 1:3142413/1‑70 CATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT > 1:1376946/1‑70 CATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT > 1:924263/1‑70 CATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:830909/68‑1 ATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT > 1:1048100/1‑69 ATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT > 1:4486439/1‑69 TACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT < 1:1116611/68‑1 ACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACAT > 1:1803605/1‑61 CCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG > 1:1130608/1‑63 CCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:181997/63‑1 CCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC < 1:1764109/60‑1 CGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT > 1:2365031/1‑61 ACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG > 1:4147618/1‑48 ACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC > 1:1752553/1‑46 TGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGAACATCCGT > 1:1828157/1‑45 CTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT < 1:1010303/41‑1 TATACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGG > 1:4188040/1‑66 TACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGG > 1:3452538/1‑64 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGA > 1:24090/1‑71 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGC > 1:909754/1‑60 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGC > 1:2317699/1‑58 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGC < 1:4107532/58‑1 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTAT > 1:3639107/1‑44 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGT < 1:3237048/36‑1 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1:4572108/54‑1 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGG > 1:260509/1‑54 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGT > 1:3563389/1‑45 GTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAG < 1:2948879/71‑1 GTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCA < 1:3832951/66‑1 GTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCA < 1:1411370/66‑1 GTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCA < 1:351496/66‑1 TATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGG > 1:2094515/1‑71 TATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGG > 1:1455141/1‑71 TATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGG < 1:83273/71‑1 TATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGA > 1:1099537/1‑67 TATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAG < 1:976187/66‑1 TATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCT < 1:4226820/60‑1 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1:418332/71‑1 TACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAG > 1:1246844/1‑68 TACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCA > 1:185472/1‑63 TACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTT < 1:3329359/59‑1 TACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTG > 1:3685589/1‑56 TACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATG > 1:3084279/1‑49 TACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTA > 1:794052/1‑47 TACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTA > 1:3278356/1‑47 TACACAATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGG > 1:1850399/1‑44 CAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/381119‑381043 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccgtatACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCA > W3110S.gb/381065‑381134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |